1.避免微生物污染純水處理設備

在設備的運行過程中，需要嚴格的查看RO反滲透膜的入水水體，在操控滲水的微生物的菌落數，同時也要了解RO反滲透膜設備的給排水效果如何，濃水以及反滲透膜的細菌數量在運行中，嚴格把控進到RO反滲透的入水水體的細菌數量，在夏天可以每天開展一次反沖洗流程，在具體運行中，應嚴控使用量，避免使用量，尤其是氧化劑超標準。由于進水里有硫復原菌(SBR)，亞硫酸能夠成為病菌營養成分，為細菌的繁殖給予苗床。

2.避免膜溶解和毀壞

水的電導率高，擴散系數大，操作溫度要求不高，機械穩定性好，純水處理設備生產廠家，耐熱性，耐化學性和水解反應可靠性，但不抗游離氯，抗積垢和環境污染能力較差。運行時應嚴格把控滲水游離氯。一般可根據游離氯檢測儀或ORP監控。檢測器檢測滲水游離氯，儀器設備應定期維護。當余氯含量超出限制值時，水無法進到反滲透設備。當游離氯出現意外進到反滲透設備時，要用過量無水亞硫酸鈉（氧化劑）去除余氯。

3.按時清理RO反滲透膜

每一次關掉反滲透設備前，雙蒸水高流量低電壓清洗，能降低膜污染阻塞速率，增加RO反滲透膜的化學水處理周期時間。RO反滲透膜達到化學水處理規定或一段時間后，針對不同，應用不一樣使用量對反滲透裝置開展化學水處理，可以提高設備的運轉特性。

以純水處理設備生產廠家為主體的醫療污水處理工藝多見RO反滲透和活性炭過濾、離子交換法、超濾膜或微濾結合的綜合性處理辦法都是二次RO反滲透或反滲透與分餾的融合。美國藥典要求，注入水需要通過分餾或RO反滲透開展。